Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 42.000 studenter, 7.000 anställda och en omsättning på 6,7 miljarder kronor.

Denna forskartjänst är del av ett interdisciplinärt forskningssamarbete mellan avdelningen för visuell information och interaktion vid institutionen för informationsteknologi och Science for Life Laboratory.

Institutionen för informationsteknologi bedriver forskning och utbildning i ett spektrum av områden inom datavetenskap och IT. Forskningen är organiserad i fem avdelningar, och avdelningen för visuell information och interaktion huserar Centrum för bildanalys, som har en lång tradition inom teoretisk och tillämpad forskning och forskarutbildning i digital bildbehandling och vetenskaplig visualisering. Fokus är på bildbehandling som sådan, men också på utveckling av bättre metoder, algoritmer och system för tillämpningar inom främst livsvetenskaper, medicin och digital humaniora, bl.a. handskriftsigenkänning. För mer information, se www.it.uu.se.

Science for Life Laboratory, SciLifeLab, är ett nationellt centrum för molekylära biovetenskaper med focus på forskning inom hälsa och miljö. SciLifeLab kombinerar ledande teknisk expertis med avancerad kunskap om medicin och molekylär biovetenskap, och är ett samarbete mellan fyra universitet: Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. SciLifeLab grundades 2010 och blev ett nationellt center 2013. Idag arbetar ungefär 1 500 personer vid de två noderna i Stockholm och Uppsala (www.scilifelab.se).

Forskningsprojekt: Digital avbildning av medicinska vävnadsprover och genetisk analys är två snabbt växande områden inom patologi. Målet för detta projekt, finansierat av Europeiska forskningsrådet (erc.europa.eu), är att utveckla beräkningsmetoder för att brygga dessa två områden genom att kombinera spatiellt upplöst genetisk analys av vävnadsprover med digital bildanalys av vävnadsmorfologi. Doktoranden kommer vara inblandad i utvecklingen av avancerade metoder för digital bildbehandling och dataanalys, men också ha ett nära samarbete med forskare från det biomedicinska området och bland annat arbeta praktiskt med till exempel bildinsamling.

Vi söker nu någon som kan fylla rollen som expert inom datoriserad bildanalys med ansvar för fortsatt utveckling av metoder för analys och visualisering av vävnadsdata. Den sökande förväntas samarbeta med våra projektpartners och vara inblandad i handledning av doktorander och master studenter. Uppgifterna inkluderar utveckling av metoder för analys av data från storskaliga mikroskopiexperiment, och metoderna sträcker sig från lärande-baserade bildsegmenteringsmetoder och klassificering till statistisk analys och visualisering.

Kvalifikationskrav: De sökande förväntas ha en doktorsgrad (eller motsvarande) inom datoriserad bildanalys eller liknande område, kombinerad med dokumenterad erfarenhet från storskalig behandling och analys av bild data. Erfarenhet från arbete med mikroskopidata och life-science tillämpningar värderas högt i bedömningen; speciellt erfarenhet från erfarenhet av storskalig bildanalys. Utmärkta kunskaper i muntlig och skriftlig engelska är ett krav.

Bedömningsgrunder: Vid urval bland behöriga sökande kommer stor vikt att fästas vid vetenskaplig skicklighet relevant för projektet; forskningserfarenhet inom datoriserad bildbehandling, hantering och analys av mycket stora datamängder, vetenskaplig datahantering och maskininlärningsmetoder. Publikationer som huvudförfattare i högt värderade tidskrifter och konferenser är en viktig merit. Särskilt stor vikt kommer också att fästas vid dokumenterade programmeringskunskaper. Dokumenterade erfarenheter av samarbete i grupp och organisatorisk förmåga är meriterande. Eftersom fokus i projektet är på mikroskopidata och tillämpningar i livsvetenskaperna anses erfarenheter och/eller starkt intresse i dessa områden som meriterande. Bedömningen av ansökningarna baseras framförallt på den sökandes förmåga att bedriva självständig forskning grundad i vetenskaplig skicklighet. Större vikt fästs vid kvaliteten på enskilda vetenskapliga arbeten än på mängden publikationer.

Arbetsuppgifter: Tjänsten är fokuserad på forskning, men kan komma att innefatta viss undervisning (max 5%) och institutionstjänstgöring (max 5%).

Ansökan: Ansökan ska innehålla en detaljerad (max 2 sidor) motivering till att söka denna tjänst, beskrivning av forskningsintressen, relevanta kvalifikationer och en beskrivning av den sökandes doktorsavhandling. Ansökan ska också innehålla en meritförteckning (CV), kopia på relevanta betygshandlingar (översatta till svenska eller engelska), en länk till doktorsavhandlingen, en publikationslista med de fem viktigaste publikationerna markerade och beskrivning av kandidatens specifika insats, samt ev. andra relevanta dokument. Dessutom kan sökanden tillhandahålla referenser (med kontaktinformation) och maximalt två rekommendationsbrev.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning t.o.m. 2 år.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av 
Professor Carolina Wählby, tel. +4618 4713473, carolina.wahlby@it.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 15 januari 2018, UFV-PA 2017/4480.

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Snarast
Löneform Fast Lön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2017/4480
Facklig företrädare
  • Ellena Papaioannou, Seko, 018-471 3315
  • Suzanne Borén Andersson, TCO/ST, 018-471 6251
  • Per Sundman, Saco-rådet, 018-471 1485
Publicerat 2017-12-20
Sista ansökningsdag 2018-01-15

Tillbaka till lediga jobb