Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 42.000 studenter, 7.000 anställda och en omsättning på 6,7 miljarder kronor.

Som en del av den nationella infrastrukturen för genomik (National Genomics Infrastructure, NGI) vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab, www.scilifelab.se), erbjuder SNP&SEQ-teknologiplattformen nästa generations sekvenseringsteknologi (Next Generation Sequencing, NGS) och SNP-genotypning som en service åt forskare i och utanför Sverige (www.sequencing.se).

Vill du jobba inom ett av världens snabbast växande teknikområden? Vi söker nu två bioinformatiker till SNP&SEQ-teknologiplattformen, Institutionen för medicinska vetenskaper (IMV), biomediciskt centrum (BMC), Uppsala universitet.

Arbetsuppgifter
Som bioinformatiker vid SNP&SEQ-teknologiplattformen arbetar du jämsides med forskare och systemutvecklare i en dynamisk och kreativ miljö vid ett av Europas största sekvenseringscenter. Sekvenseringsinstrument vid plattformen inkluderar Illuminas MiSeq, HiSeq2500, HiSeqX och NovaSeq 6000-system.

Bioinformatikerna ansvarar för att hantera och analysera den sekvensdata som produceras vid plattformen. Detta inbegriper bearbetning, kvalitetskontroll, analys och leverans av data till uppdragsgivare. I arbetsuppgifterna ingår även utveckling och underhåll av de system som används för detta ändamål. En stor del av arbetet kan också omfatta analys av data inom interna och externa forskningsprojekt, samt utveckling och underhåll av pipelines för dataanalys. Till exempel kommer du att samarbeta med SNP&SEQ-plattformens forsknings- och utvecklingsgrupp, med sikte på att utveckla automatiserade pipelines för dataanalys av nya laboratoriebaserade metoder som utvecklats vid plattformen.

Kvalifikationskrav: 

  • Civilingenjörsexamen eller motsvarande, gärna med inriktning mot bioinformatik, molekylär bioteknik eller molekylär genomik.
  • Erfarenhet av forskningsarbete (t.ex. doktorsexamen) eller annat relevant arbete med inriktning mot bioinformatik.
  • Erfarenhet av att analysera data i R, Matlab eller motsvarande miljö.
  • Erfarenhet av att utvärdera och analysera data från storskalig DNA-sekvensering och tillhörande applikationer (t.ex. RNA-seq, sequence capture, WGS, WGBS, RRBS, ChIP-seq, scRNA-seq, etc).
  • God vana av att arbeta i Linuxmiljö och av shell skriptning.
  • Goda kunskaper i programmering med t.ex. Python, Java, Scala eller Perl.
  • Mycket goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska.

Vi söker noggranna personer med öga för detaljer, initiativförmåga och ansvarskänsla, samt god förmåga till både självständigt arbete och arbete i grupp. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper, såsom positiv attityd och god samarbetsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt:

  • Erfarenhet av användande av datorkluster.
  • Kunskap eller intresse för biomedicinsk forskning
  • Erfarenhet av bioinformatisk metodutveckling.
  • Dokumenterad erfarenhet av arbete inom ackrediterad sekvenseringsverksamhet.
  • Kunskaper i svenska.

Ansökan skall innehålla CV, kopior av examensbevis och betyg, eventuella publikationer och en kort beskrivning av dina forskningsintressen. Vi ser gärna att du lämnar uppgifter om referenspersoner och/eller bifogar rekommendationsbrev. Ansökningarna bedöms enligt följande kriterier: lämplig formell utbildning, tidigare erfarenhet av bioinformatik, kommunikation och metodutveckling samt personlig lämplighet.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning (vikariat) 1 år, med möjlighet till förlängning.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av
Pontus Larsson (pontus.larsson@medsci.uu.se)
Jessica Nordlund (Jessica.nordlund@medsci.uu.se)
Prof. Ann-Christine Syvänen (ann-christine.syvanen@medsci.uu.se)

Välkommen med din ansökan senast den 18 april 2018, UFV-PA 2018/908.

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Snarast
Löneform Fast lön
Antal lediga befattningar 2
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2018/908
Facklig företrädare
  • Ellena Papaioannou, Seko, 018-471 3315
  • Suzanne Borén Andersson, TCO/ST, 018-471 6251
  • Per Sundman, Saco-rådet, 018-471 1485
Publicerat 2018-03-15
Sista ansökningsdag 2018-04-18

Tillbaka till lediga jobb